Pod plaštom stvaranje jedinstvene i nedjeljive, multinacionalne i multikulturalne Republike Bosne i Hercegovine, sa jednakim pravima za sve konstitutivne narode, ekstremnom, političkom i vojnom rukovodstvu BiH iz reda muslimanskog naroda, glavni i osnovni cilj je bio stvaranje islamske države na prostorima Bosne i Hercegovne
Za ostvarivanje ranije pripremljenih i planiranih ciljeva, muslimansko rukovodstvo na čelu s Alijom Izetbegovićem, kao predsjednikom Stranke demokratske akcije i Predsjednikom predsjedništva BiH i drugim muslimanskim intelektualcima, a uz podršku islamskih zemalja, radili su na stvaranju uvjeta za ostvarivanje planiranog. U tom smislu poduzimali su više radnji na konstitutiranju muslimanskih tjela od pripadnika “provjerenih islamista” koji su opredjeljeni za provođenje tih ideja. Ovo su opisi djela kaznene prijave koju je podnijelo Ministarstvo unutarnjih poslova HR HB, dana 09.04.1996. godine. Kaznenom prijavom od 6-17 stranice, kao zapovjednici u generalštabu i korpusima A BiH su izravno i preko svojih podređenih postrojbi, a po nalogu stranačkog i državnog muslimanskog vrha BiH, planski, kordinirano i organizirano činili pojedinačna i masovna ubojstva, etnički čistili hrvatsko pučanstvo, formirali konc logore i zatvore, nehumano postupali prema civilnom pučanstvu i ratnim zarobljenicima, uništavali imovinu i kulturno povjesne spomenike hrvatskog naroda, organizirali postrojbe stranih plaćenika tzv. “mudžahedina”, koje su bile sastavni dio A BiH, čime su počinili više kaznenih djela koja su u suprotnosti odredbama Ženevskih konvencija. U prilogu kaznena prijava, koja je nestala u ladicama nadležnih institucija HR HB. Po našim saznanjima po ovoj kaznenoj prijavi nije se postupalo, s obzirom da je došlo do smjene ministra i njegovih suradnika koji su sačinili kaznenu prijavu. Period od travnja 1996. godine, do svibnja 1998. godine ovjekovječen je političkim internim previranjima vodstva HR HB. Petim saborom HDZ-a, koji je održan 16. svibnja 1998. godine , za predsjednika HDZ-a dolazi čovjek koji nije imao nikakve veze s HDZ-om, dodatno komplicira činjenica da je bio oficir JNA., on je nametnut od strane međunarodne zajednice, za lidera Hrvata BiH. To je politički proces kojim započinje kalvarija hrvatskog naroda u BiH. Primjer, nakon 1998. godine za ministra obrane Federacije BiH, kao predstavnik Hrvata imenuje se zastavnik JNA. Strukture JNA, preuzele su vodstvo HDZ-a BiH, dolazi do progona, podizanja optužnica časnicima , dočasnicima , vojnicima HVO-a, dok se zanemaruju i gube kaznene prijave protiv vojnog rukovodstva Armije BiH, koje su podnijeli predstavnici Ministarstva unutarnjih poslova HR HB.
